Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl6P47911 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl6P47911 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms