Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SrprbP47758 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms