Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms