Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ItgavP43406 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ItgavP43406 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.5 ms