Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pik3caP42337 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms