Protein–RNA interactions for Protein: P41731

Cd63, CD63 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd63P41731 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd63P41731 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd63P41731 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd63P41731 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms