Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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