Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt4P40749 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt4P40749 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt4P40749 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt4P40749 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt4P40749 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt4P40749 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms