Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms