Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col18a1P39061 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms