Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms