Protein–RNA interactions for Protein: P35917

Flt4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt4P35917 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flt4P35917 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flt4P35917 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flt4P35917 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flt4P35917 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Flt4P35917 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Flt4P35917 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Flt4P35917 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Flt4P35917 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Flt4P35917 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Flt4P35917 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Flt4P35917 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt4P35917 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt4P35917 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt4P35917 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt4P35917 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt4P35917 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Flt4P35917 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt4P35917 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt4P35917 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt4P35917 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt4P35917 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt4P35917 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt4P35917 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt4P35917 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt4P35917 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Flt4P35917 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt4P35917 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Flt4P35917 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt4P35917 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt4P35917 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt4P35917 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt4P35917 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt4P35917 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt4P35917 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt4P35917 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt4P35917 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt4P35917 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt4P35917 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt4P35917 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Flt4P35917 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Flt4P35917 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt4P35917 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt4P35917 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt4P35917 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt4P35917 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt4P35917 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Flt4P35917 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt4P35917 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt4P35917 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt4P35917 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt4P35917 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt4P35917 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt4P35917 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms