Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms