Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd1P33215 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd1P33215 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms