Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rom1P32958 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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