Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Notch4P31695 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Notch4P31695 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Notch4P31695 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms