Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nedd8P29595 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms