Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mmp3P28862 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mmp3P28862 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms