Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Col2a1P28481 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col2a1P28481 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms