Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hoxd10P28359 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Hoxd10P28359 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd10P28359 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd10P28359 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms