Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vav1P27870 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vav1P27870 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vav1P27870 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vav1P27870 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vav1P27870 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms