Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afxP27661 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms