Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CftrP26361 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CftrP26361 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CftrP26361 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CftrP26361 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CftrP26361 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CftrP26361 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CftrP26361 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CftrP26361 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CftrP26361 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CftrP26361 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CftrP26361 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CftrP26361 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CftrP26361 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CftrP26361 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CftrP26361 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CftrP26361 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CftrP26361 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CftrP26361 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CftrP26361 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CftrP26361 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CftrP26361 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CftrP26361 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CftrP26361 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CftrP26361 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CftrP26361 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CftrP26361 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CftrP26361 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CftrP26361 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CftrP26361 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CftrP26361 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CftrP26361 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CftrP26361 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CftrP26361 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CftrP26361 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CftrP26361 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CftrP26361 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CftrP26361 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CftrP26361 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CftrP26361 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CftrP26361 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CftrP26361 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CftrP26361 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms