Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna1P26231 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms