Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo2P25801 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo2P25801 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms