Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd247P24161 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd247P24161 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd247P24161 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd247P24161 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms