Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Olfr700-202ENSMUST00000214840 1505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Hoxd11P23813 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Hoxd11P23813 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd11P23813 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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