Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZfaP23607 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZfaP23607 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZfaP23607 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZfaP23607 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZfaP23607 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZfaP23607 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZfaP23607 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZfaP23607 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZfaP23607 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZfaP23607 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms