Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms