Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tap1P21958 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms