Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prim1P20664 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prim1P20664 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prim1P20664 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prim1P20664 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms