Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms