Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18532 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P18532 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18532 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18532 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18532 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18532 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18532 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18532 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P18532 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P18532 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18532 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18532 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18532 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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P18532 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18532 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18532 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms