Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sptan1P16546 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sptan1P16546 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms