Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra6P16305 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra6P16305 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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