Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgfr1P16092 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgfr1P16092 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms