Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkceP16054 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkceP16054 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkceP16054 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms