Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rag1P15919 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rag1P15919 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rag1P15919 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms