Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrphP15331 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrphP15331 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrphP15331 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrphP15331 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrphP15331 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrphP15331 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrphP15331 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrphP15331 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrphP15331 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrphP15331 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrphP15331 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrphP15331 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrphP15331 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrphP15331 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrphP15331 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrphP15331 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrphP15331 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms