Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmnb1P14733 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms