Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntn1P12960 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntn1P12960 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms