Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calb1P12658 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Calb1P12658 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Calb1P12658 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb1P12658 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calb1P12658 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms