Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd1d1P11609 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms