Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lire1P11260 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lire1P11260 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lire1P11260 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lire1P11260 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lire1P11260 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lire1P11260 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lire1P11260 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lire1P11260 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lire1P11260 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lire1P11260 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms