Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Schip1P0DPB4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms