Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254aP0DN89 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms