Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb1P09055 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms