Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxb7P09024 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb7P09024 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms