Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NeflP08551 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NeflP08551 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NeflP08551 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NeflP08551 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NeflP08551 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NeflP08551 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NeflP08551 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NeflP08551 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NeflP08551 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NeflP08551 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NeflP08551 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NeflP08551 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NeflP08551 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NeflP08551 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NeflP08551 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NeflP08551 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NeflP08551 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NeflP08551 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NeflP08551 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NeflP08551 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms