Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col4a2P08122 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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